第一位 东京大学
东京大学是一所本部位于日本东京都文京区国立综合性大学，是国际东亚研究型大学协会、亚洲大学联盟，和国内指定国立大学、学术研究恳谈会、超级国际化大学计划、卓越研究生院计划、领先研究生院计划、日瑞Mirai项目等组织成员。东大位列2019自然指数世界排名11；2020莫斯科国际大学排名第16位；2020软科世界大学学术排名第26位；2021THE世界大学排名第36位；2021QS世界大学排名第24位；2020U.S. News世界大学排名第74名
第二位 京都大学
日本大学排名第2，仅次于东大，京都大学是世界闻名的顶级综合研究型大学，其本部位于日本京都市左京区，是东亚研究型大学协会成员，日本文部科学省超级国际化大学计划A类顶尖校和指定国立大学。作为日本最高学府之一，京都大学在世界享有极高的声誉，被誉为“科学家的摇篮”。京都大学拥有京都大学iPS细胞研究所、京都大学生存圈研究所等多个世界顶尖且唯一的科研机构。
迄2020年，京都大学已诞生11名诺贝尔奖（亚洲第一）、3名菲尔兹奖、1名高斯奖、5名拉斯克奖、1名陈省身奖、9名京都奖、3名日本国际奖、114名日本学士院奖、6名沃尔夫奖、4名芥川奖，日本唯一的达尔文-华莱士奖章等奖项得主，以及五位日本首相。其世界500强企业CEO校友数居全球第12名，可谓巨擘辈出，其毕业生在科研学术至政商界都拥有举足轻重的地位。
第三位 日本东北大学
是一所日本顶尖、世界一流的研究型综合国立大学，世界百强大学，日本东北地方最高学府。作为日本旧帝国大学之一，东北大是日本文部科学省指定国立大学和超级国际化大学计划的A类顶尖校，八大学工学系联合会、学术研究恳谈会（RU11）、卓越研究生院计划、领先研究生院计划成员，国际高校联盟环太平洋大学联盟、东亚研究型大学协会重要成员，参与日英RENKEI等项目。该校现已涵盖文、理、工、医、农各科。
第四位 大阪大学
大阪大学是日本文部科学省设立的超级国际化大学计划A类顶尖校和指定国立大学，同时也是学术研究恳谈会（RU11）、八大学工学系联合会、卓越研究生院计划、领先研究生院计划，以及国际高校联盟环太平洋大学联盟、东亚研究型大学协会，日英RENKEI等学术组织和项目的重要成员。
大阪大学的校友涵盖了诺贝尔奖、沃尔夫奖、拉斯克奖、克拉福德奖、盖尔德纳基金会国际奖、日本国际奖、京都奖、日本文化勋章、日本文化功劳勋章、日本学士院恩赐奖、日本学士院奖得主。
除此之外，东京工业大学、名古屋大学、九州大学、北海道大学、庆应义塾大学、早稻田大学、筑波大学、广岛大学、神户大学、东京医科齿科大学、一桥大学、横滨市立大学、千叶大学、熊本大学、冈山大学、长崎大学、大阪市立大学、金泽大学、东京农工大学、鹿儿岛大学、大阪府立大学、岐阜大学、新泻大学、首都大学东京、群马大学、横滨国立大学、山口大学、名古屋工业大学、上智大学、东京理科大学、青山学院大学、同志社大学、京都工艺纤维大学、九州工业大学、明治大学、御茶水女子大学、立命馆大学、埼玉大学、信州大学、东海大学、国际基督教大学、电气通信大学、北陆先端科学技术大学院大学、东京学艺大学、长冈技术科学大学、国际教养大学、明治大学、东京艺术大学、东京海洋大学、岩手大学、静冈大学、立命馆大学、茨城大学、中央大学、立教大学、法政大学等学校也都是不错的。
中国留学生想去日本留学，最好选择的学校是东京大学，因为东京大学的教育质量。东新大区有卖其他公立类院校也是有相应的名额，可以选择适合自己专业的大学进行留学。
主要也是看你自己的条件。
条件好的话申请帝大都可以。
条件不好的一般的日本前五十的大学也可以试着申请看。
但是一定要申请适合自己，符合自己条件的学校，不然你之后的学习也会有困难。
一上来就给你推荐帝大的中介就别考虑了，不负责的都。
你要是不差钱儿、就找留学中介帮你办，风险较小，中介大约收你一万人民币左右，当然，你也搜一下 中华人民共和国 教育部 教育涉外监管信息网 ，找预警信息等等。如果还不放心，建议你找个律师，对它进行司法类的静态调查，比如它的资质情况、财务情况、法律纠纷情况等等，包括在你和中介签署合同时，对你不利的条款方面的检查。差钱的话就自己上网联系，有一定风险。
要看你是学什么的，适合自己的才是最好的。
