发什么证与在职与否没有任何关系，发什么证取决于入学途径。你先了解个大概情况，斟酌后再定考哪种研究生。
在职考研有三条途径即统考、GCT考、自考。下面分别予以解释：
1. 统考或一月联考：就是10月报名，次年1月考。目前有很多专业，只有九个专业有半脱产班，即MBA、MPA、MPACC、JM、MTA、MEM、金融、保险、电子商务。除了这九个专业外，其他专业没有半脱产班。这九个专业适合在职人员考，其中管理类要求本科毕业满三年(至研究生开学年的9月1日满三年），其他专业应届、往届生都能报考。统考生(一月联考）属学历教育、发双证（毕业证加硕士证）。毕业证代表学历，有研究生毕业证，你的学历就变成了研究生，可以晋级、晋升职称、也可报考要求研究生学历的职位。
2.GCT考：6月25-7月10日报名，10月考。大部分专业报名条件为本科毕业并拥有学士证满三年（至报名年的7月31日满三年），只有电子与通信工程、控制工程、计算机技术等领域的考生可不受年限限制，也就是说刚领上学士证就能报考这几个专业（若报名时学士证不满三年的，读完研究生所有课程后再实习两年才准申硕）。GCT 研究生发单证（只发硕士证不发毕业证），由所读大学颁发硕士证。GCT研究生有17个专业，所有专业都有半脱产班。
3.自考（就是同等学力申硕)：没有工龄限制，入学不用考，自愿缴费读某校的研究生进修班。所学各门功课学校考都及格时，学校只能发一个研究生结业证。当你三证齐全（研究生结业证、本科毕业证、学士证），并且学士证满三年，就达到了研究生同等学力。然后本人提出申硕申请，经教育部验证核准后就有资格参加每年5月国家组织的同等学力申硕考试，也就是国考，国考由国务院命题，考试及格的由国务院学位办颁发硕士证。各大学的研修班有各种形式，如全脱产、半脱产、周末班、函授班。
GCT考和自考研究生都属非学历教育，没有毕业证。读完这两种研，你的学历还是原来的本科，不能报考要求研究生学历的职位，但这个硕士证在晋级、晋升职称时管用 。获双证的唯一途径就是参加统考（一月联考）。如果读了GCT研究生或自考研究生，又想拿研究生毕业证，那就得重新参加一月研究生统考，被录取后再从头读统考的研究生，才能拿到研究生毕业证。统考、GCT考、自考是三个不同的体系，学分不能互顶，必须重新考，从头读。
如果对目前工作不满意，获取双证很有必要，好单位聘人要双证生；如果现在工作挺好，考个GCT或自考研究生都行，反正这个硕士证在晋级、晋升职称时都按研究生对待。GCT研究生、自考研究生都不转户、不转档、不派遣（读完研后回原单位，学校不给推荐工作），对找好工作意义不大。统考最难，自考次之，最好考的是GCT研究生。
何为全日制？不要简单地误认为全脱产学习就是全日制，我们应以人事局的解释为依据：“一月份考上的研究生为全日制研究生，六月份考上的大学生为全日制大学生”。这是人事局的标准答案。人事局代表政府，政府说了算。不管学硕还是专硕，只要是一月考研录取的，不管采取哪种形式上课，比如全脱产、半脱产、周末班，都发双证。全日制不代表全脱产，全日制是统考（一月联考）生的代名词，只要是一月考研录取的都叫全日制研究生，不论是否是全脱产上课。双证研究生就叫全日制研究生。除了一月研叫全日制外，别的研（单证)就是全脱产上课也不能叫全日制。同理只有6月份统考录取的大学生才能发普通高等教育毕业证，也就是人事局认定的全日制毕业证。至于成考、自考大学生，分别发成人高等教育毕业证和高等教育自考毕业证，自考和成考大学生就是全脱产上课也不属全日制。全日制是统考生的代名词，抬头（毕业证最上边一行字）写普通高等教育的大学毕业证就叫全日制毕业证。全日制是个时髦的词汇，一定要弄懂它的内涵，现在考公务员、事业编、单位招聘时提及的全日制，均以人事局的答案为标准。研究生每年学费一般是本科生的二倍，但管理类专硕比较贵，学校不同学费也异。
土木工程专业，最好读工程硕士吧！
在职硕士学位获取方式如下：
10月份全国联考：GCT、教育硕士、MBA、公共管理硕士、公共卫生硕士等在职研究生考试，7月份报名、10月底全国联考，单证。GCT考试包含工程硕士、农业推广硕士、风景园林硕士等专业，其中电子与通讯工程、控制工程、计算机技术、软件工程可不受工作年限限制。GCT考试科目有语言表达能力、数学基础、逻辑推理、英语四门，具体考试形式及题型试卷，在“清华在线”可以找到。2013年的GCT网上报名时间是6月20日——7月14日，考试时间是10月27日。学费3-4万，学制3年。毕业只能拿到国家认可的学位证书，没有学历证书。在职研究生，除了MBA、EMBA等可以拿双证意外，其他的都只能拿到学位证书。
同等学历申硕：一般免试入学，参加课程进修班，修满学分后参加每年5月份的考试，通过后可获硕士学位证书。学费比GCT要低一些。
1月份统考：MBA、MPA、MPACC、MEM和法律硕士，双证（包含学位证和学历证），含金量最高，考试最难。学费也相对高些。
在职研究生软件工程硕士：自主命题、自主招生，全国只有35所高校，如北京航空航天大学、天津大学、山东大学等，无工作年限要求。考试通过率较高，招生时间由学校安排，基本每年都分四批录取，具体可以关注一下该学校的官方网站。
希望可以帮助到您。
我觉得你可以根据自己目前的职业方向来选择报考专业，不过你是土木工程毕业的 选工程硕士报考在录取上还是比较占优势的，如果你想要报考在职硕士 我觉得报考985高校比较靠谱 花了钱更少不了花经历 当然要选比较好的学校才值！
前者，毕竟你是学土木工程的
